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ORF的查找  

2011-01-09 14:19:02|  分类: Bioinformatics |  标签: |举报 |字号 订阅

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    ORF(open reading frame)是一个没有终止编码的密码子序列。对于任何给定的核酸序列(单链DNA或mRNA),根据密码子的起始位置,可以按照3种方式解释。

   ORF的查找如下:

1。打开 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi
输入所要查询的基因序列的GI或者fasta格式。
2。查看结果。
   选取可靠的结果

3。检验结果

    将ORF翻译成氨基酸序列,然后将结果序列与序列数据进行比较(BLAST),如果发现1个或多个显著相似序列,则所预测ORF的可信度较高。

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