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NCBI Entrez Gene(1): 查找基因  

2010-10-25 11:06:44|  分类: Bioinformatics |  标签: |举报 |字号 订阅

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本文转载自Portion For Fox《NCBI Entrez Gene(1): 查找基因》

 

引用

Portion For FoxNCBI Entrez Gene(1): 查找基因

美国生物信息技术中心(NCBI)的字库Entrez Gene主要提供人类及其他动物等基因信息。

基因的内容非常多,以后将不断补充。

1、打开NCBI主页。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

2、在下拉框中选Gene。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

3、输入查找的基因ID。

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4、结果显示MAPK8基因相关信息,红框内为基因的简介。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

5、点击see related,可以看到该基因的详细介绍(蛋白定位、结构、表达情况、转录子数等等)。如OMIM、Human Protein,EBI等信息。

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6、回到主页,染色体他信息,转录子序及蛋白等信息。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

7、点击右上角的 see MAPK8 in Mapviewer(染色体定位)。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

8、参考文献可以看到相关该基因研究的文献,并可打开链接。

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9、Interaction:一般包括HIV和普通的蛋白间的相互作用。

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10、Genotypes:基因型。Pathway:功能通路。点击GeneView 和Genotype report。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

1)点击GeneView,可见SNP信息,该基因有4个SNP。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

第一个SNP的具体信息,包括外显子的位点,克隆点等信息。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

2)世界主要人种的遗传连锁不平衡分析。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

11、回到主界面,以下为GO分析,包括fucntion,process,component说明该基因的功能,参与的过程和组成什么成分

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

12、蛋白的信息。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

13、参考序列,包括转录组合蛋白组的。

NCBI Entrez Gene(1): 查找基因 - Portion For Fox - Into the Fire

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14、相关序列。

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15、其他链接,可以连接到其他数据库。

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